عفونتهایی که از طریق تماس جنسی منتقل می شوند(Sexually transmitted infections)معضلی مهم و فراگیر در بخش های مختلف جهان می باشند.مطابق گزارش WHO بیش از یک میلیون ابتلا به STI هر روز در سرتاسر جهان رخ می دهد.اگر این بیماریها درمان نشوند می توانند به مشکلات جدی و طولانی مدت از جمله ناباروری شوند.در زمان بارداری نیز می توانند سبب مرگ داخل رحمی،تولد زودرس یا آسیب به جنین گردند.علاوه بر این ،این عفونتها می توانند در حین زایمان به نوزاد منتقل شده و سبب عفونتهای شدید در نوزاد شوند.

تشخیص STI چالش برانگیز است.چرا که این بیماریها در بسیاری از موارد بدون علامت هستند و ممکن است وقتی شناسایی شوند که آسیب غیر قابل برگشت ایجاد کردند.امکان عفونت با چند پاتوژن نیز به پیچیدگی تشخیص بیماری می افزاید.بنابراین تستهای آزمایشگاهی نقش مهمی در شناسایی این عفونتها دارند.تشخیص بر مبنای PCR یکی از مهمترین روشها،بویژه در مورد پاتوژنهایی که نمی توان آنها را کشت داد،می باشد.تشخیص بر اساس PCR،امکان شناسایی هر دو عفونت خاموش و آشکار را فراهم می سازد و بنابراین برای تشخیص بیماران علامت دار و غربالگری عمومی هر دو مفید می باشد علاوه بر این بخاطر تکثیر DNA پاتوژن،عفونتهایی که در آنها تعداد پاتوژن کم است نیز به خوبی قابل تشخیص و شناسایی هستند.